Ce que nous en savons pour le moment ! (Source = Wikipédia)
Avant le Grand PrixSix mois après l'affrontement avec les Dark Signers, la Ville et Satellite sont entièrement connectées, et les Turbo Duels utilisent à présent le 'Monde de Vitesse 2' et des voies de duel spéciales sont aménagées à travers la ville. Akiza, Lua et Luca retournent à la Duel Académie pendant que Yusei, Jack et Crow se préparent pour le prochain tournoi Grand Prix Mondial de Duel Turbo (WRGP). Cependant, une nouvelle menace apparaît quand Ghost, un duelliste robot, commence à attaquer les participants au WRGP en détruisant leurs Duel Runners. Yusei affronte et bat Ghost pour finalement découvrir qu'il n'était qu'un Turbo Roïd reprogrammé par Placido, un membre d'Yliaster. Puis l'histoire principale reste en suspense et plusieurs épisodes sans lien avec l'histoire sont diffusés : Yusei affronte Pr Rudolf Heitmann, un professeur de la Duel Académie qui veut renvoyer Lua, Luca et leurs amis. Crow se bat contre un homme appelé Tetsuzo pour que celui-ci rentre chez Martha. Jack mit son deck et son runner dans un duel contre un escroc du nom de Garome pour annuler tous les faux contrats que ce dernier a fait subir à de pauvres familles. Yusei et Lua vont à la rescousse de Luca qui s'est faite kidnappée par une esprit nommé Michel. Ensuite, Yusei est capturé par une équipe rivale, voulant qu'il rejoigne leur rang. Celui-ci est sauvé par Akiza et Mina. C'est alors qu'une Turbo Duelliste du nom de Sherry Le Blanc vient affronter Yusei, déterminée à l'avoir dans son équipe. Celui-ci accepte le duel, pendant qu'Akiza les observe sur le même Duel Runner que lui. En les regardant, celle-ci trouve de l'intérêt dans les Turbo Duels. Juste au moment où Yusei reprend l'avantage, le patron de l'équipe qui a kidnappé Yusei essaie de les tuer, mais ils sont sauvés par les pouvoirs d'Akiza. Yusei lui demande de piocher sa prochaine carte, mais celle-ci refuse affirmant qu'elle ne veut pas que Yusei rejoigne son équipe sur un duel qui a été interrompu. Elle part tandis qu'Akiza semble déterminée à devenir une Turbo Duelliste afin de mieux comprendre Yusei, si bien qu'elle décide, quelque temps après, de prendre des leçons de moto sur le circuit de la Duel Académie. Après avoir obtenu sa licence, elle se retrouve confrontée à Trudge dans son tout premier Turbo duel. Inquiet au sujet de savoir comment battre le Tueur de Synchros de Ghost, Yusei est approché par un homme se faisant appeler Dark Glass, qui lui apprend une nouvelle méthode appelée Accel Synchro. Plus tard, Lua et Luca sont attaqués par un autre membre d'Yliaster, Luciano, qui possède lui aussi un Tueur de Synchros. Ils arrivent seulement à survivre grâce aux efforts du Dragon Cramoisi et des esprits de Duel de Monstres de Luca. Plus tard, Mina et Trudge demandent à Yusei, Jack et Crow de s'occuper de Bruno, un garçon amnésique mais qui est un mécanicien extrêmement talentueux. Yusei et lui créent un programme surpuissant pour le moteur du nouveau Duel Runner de Yusei. Mais le programme est volé. Après avoir résolu un puzzle sous forme de duel informatique, ils découvrent l'identité du voleur : Lazar... Il s'en suit une série de tentatives de capture de Lazar par Yusei, Crow, Jack et Bruno. Ils se retrouvent tous les cinq dans le repère de Placido qui programme un Robot pour affronter Yusei en duel.
Crashtown Pour sauver son ami de la Team Satisfaction, Kalin Kessler, Yusei se rend à CrashTown - une ville dans le désert - qui est gouvernée par le duel. Il y rencontre Barbara. Celle-ci lui explique que Kalin est un membre du gang de Ramon. Au crépuscule, On voit Kalin affronter un duelliste du gang de Malcolm. Yusei voit Kalin affronter ses adversaires sans merci. Il a essayé d'appeler Kalin mais il n'a reçu qu'un retour glacial et Kalin s'en est allé avec son Duel Runner rejoindre son gang. Yusei décide alors de rejoindre le gang de Malcolm afin de sauver Kalin de cette ville de duels de gang. Yusei arrive alors à affronter Kalin. Le duel continue, quand soudain le chef du gang Lotten, revient et détruit les disques de duel du gang de Ramon. Barbara immobilise Yusei, révélant qu'elle connait la situation de Kalin, qu'elle est la fiancée de Malcolm et qu'elle l'a utilisé pour se débarrasser de Kalin pour que Malcolm règne sur les gangs de Crashtown. Envoyés aux mines, Yusei et Kalin arrivent à s'échapper. C'est alors qu'ils rencontrent West et Nico qui lui rendent son Duel Runner. Afin de faire sortir les gens de la mine, Yusei affronte Lotten. Pendant ce temps Kalin sauve Sergio, West et le père de Nicko, et se bat contre les sbires de Lotten afin de s'échapper. Crashtown est maintenant sous le contrôle de Lotten. Mais Yusei Fudo et Kalin Kesler arrivent. Le duel commence alors avec Yusei et Kalin contre Lotten, avec le sort de la ville en jeu.
Le Grand Prix Un ancien ami de Satellite de Crow, Pearson, avait été tué par un duelliste par la carte mortelle Mephist Sanglant. Il commence alors à chercher le criminel, ce qui le mène à rencontrer Bolger, président d'une société de D-Wheel, un homme qui a autrefois travaillé pour Pearson. Mais Bolger ne veut rien dire et il parlera à une seule condition : un duel avec Crow. En effet, en cas de victoire, celui-ci demande le cinquième dragon des Pactisants, Dragon Aile Noire, afin de récupérer de l'argent en le vendant. Crow parvient à le vaincre et à lui faire regretter d'avoir tuer Pearson. Il récupère alors ses sentiments de protéger les enfants de Satellite, et aide Yusei en améliorant son Duel Runner.
Etant donné que le WRGP approche, Yusei et ses amis visent le haut du tableau des éliminatoires, et donc ils font une course d'entrainement sur le circuit. Toutefois, Crow veut continuer à faire des tours de circuit et il percute un des membres de la Team Unicorn. Afin d'éviter tout problème avant les préliminaires, Yusei affronte Andore, le meilleur joueur des Unicorn, dans un duel Turbo. Les tours préliminaires du WRGP commencent enfin. Yusei et les autres y participent en tant que Team 5D'S. Cependant, leur premier match les opposent à la Team Unicorn qu'ils ont déjà rencontré. Jack combattra en premier, suivi par Akiza, et enfin Yusei. Sûr de son coup, Andore les attend de pied ferme. Cependant, celui-ci les piègent et Jack Atlas ainsi qu'Akiza sont battus coup sur coup par cet astucieux adversaire. Il ne reste plus qu'un moyen pour la team 5D'S de remporter la victoire : que Yusei arrive à battre 3 adversaires d'affilée...
Après la victoire de l'équipe 5D'S sur l'équipe Unicorn, cette dernière se fait battre par la Team Catastrophe et Andore et Jean sont grièvement blessés. Akiza, pendant ce temps, est victime d'un "accident" semblable à celui de Crow. Cela est dû à la carte des Ténèbres de la Team Catastrophe "Le Chevalier au crochet caché" qui leur a été offerte par Yliaster. Le prochain match oppose les équipes 5D's et Catastrophe. Pendant le duel entre Crow et Hermann, le crochet du chevalier de la carte des Ténèbres sort de l'ombre de son D-Wheel et tente de le faire tomber. Crow parvient à éviter les attaques du Chevalier au crochet caché. Crow arrive à mettre hors jeu Hermann, ainsi que sa carte des Ténèbres. Le deuxième match oppose Jack à Nicholas. Nicolas utilise une autre carte des ténèbres, destinée à les mettre tous les deux hors jeu. Malgré tout, Jack reste dans la partie grâce à l'effet de son monstre ce qui, comme le Duel Runner de Nicholas est détruit, donne à l'équipe 5D's son billet pour la finale.
Placido envoie son armée de Duel Runner Robots, le Diablo, à travers la ville. Elle sème le chaos en battant des dizaines de duellistes avec leur mode Bataille Royale. Yusei, Jack et Bruno, rejoint par Kazama, Mizoguchi et Sherry partent donc affronter l'armée des Ghosts en se divisant en petit groupes. Yusei se retrouve face à des dizaines de Ghosts et semble à bout. Bruno, qui a recouvert sa mémoire, se révèle être Dark Glass et vient au secours de Yusei. C'est alors que Placido entre dans la partie pour en finir avec Yusei. Ce dernier est alors déterminé à faire l'Accel Synchro grâce au Clear Mind et au Momentum. Yusei accélère à des vitesses folles et est capable de voir un nouveau monstre. Le duel commence entre Placido et Bruno, qui s'étaient déjà combattu auparavant mais qui avait résulté sur le crashage de Bruno dans la mer. Yusei arrive à un cratère, où une autre dalle de pierre a atterri. En la touchant, il est transporté dans la salle blanche où il avait déjà été, et où il reçoit une carte d'Accel Synchro. Placido invoque son monstre Wisel et Bruno invoque les monstres permettant de faire son Accel Synchro. Mais le duel sera mis en difficulté par les Ghosts venus en renforts.
Yusei arrive et défie Placido qui se transforme et fusionne avec son Duel Runner. Yusei est alors face à Placido et à son empereur machine "Wisel Infinity". Yusei invoque donc un monstre synchro, son "Junk Destroyer" et Placido tente de l'absorber mais Yusei arrive à le contrer. Le Pactisant tente donc le tout pour le tout en invoquant son "Stardust Dragon" et en tentant une Accel Synchro mais qui à sa grande surprise rate ! Placido absorbe donc le "Stardust Dragon" de Yusei. Il commence à être frustré sur la raison pour laquelle son Accel Synchro a échoué. Arrivant tout juste à survivre aux attaques de Placido, Yusei arrive finalement à récupérer son Dragon Poussière d'Étoile. Placido fait démarrer une tornade qui commence à affecter la ville, mettant Haruka, un enfant, en danger. Cependant, Akiza arrive à la sauver. C'est alors que Yusei regagne sa détermination en faisant le vide dans son esprit, lui permettant alors de réaliser une Accel Synchro et d'invoquer son Dragon Étoile Filante, dispersant la tornade. Il utilise sa faculté spéciale et la volonté de ses amis pour attaquer Placido cinq fois d'affilée remportant la victoire et le détruisant. Alors que Yusei retrouve Jack, Crow et Bruno, ils se retrouvent face à Luciano et à José qui se révèlent être les empereurs d'Yliaster. Ils prétendent être une organisation destinée à placer le futur sur le bon chemin après qu'il a été altéré par la création du Momentum. Ils ont pour but la destruction de Néo-Domino City. Sherry et Mizoguchi arrivent et attaquent José et Luciano, mais ne sont pas de taille. C'est alors que José reçoit sa tablette, lui donnant l'Empereur Machine Grannel. Alors qu'ils partent, ils disent à Yusei et aux autres qu'ils combattront dans le WRGP. Alors que Néo-Domino City se remet du carnage, Yusei et ses amis se préparent pour la bataille qui arrive...